9 ECTS credits
235 u studietijd
Aanbieding 1 met studiegidsnummer 1017330BNR voor alle studenten in het 1e semester met een verdiepend bachelor niveau.
De cursus biochemie geeft een inleiding tot de moleculaire design van het leven. De moleculaire structuur van nucleïnezuren, eiwitten en hun onderlinge relaties (replicatie, transcriptie, translatie) worden eerst beschouwd. Hierop volgt een korte inleiding tot de biologische membranen.
In een tweede cursusonderdeel wordt dieper ingegaan op de struktuur/funktie relatie van eiwitten. Enzymefunctie (Lysozyme, RNase A, Chymotrypsine, ...), Coöperativiteit (Hemoglobine en ATCase), enzymeregulatie en protein-folding en -design worden in detail behandeld.
Een inleiding tot het metabolisme vormt het laatste hoofdstuk van deze cursus. Hierin worden de belangrijkste catabolische en enkele anabolische patways toegelicht (glycolyse, Krebbs cyclus, oxidatieve fosforylatie, glycogeen metabolisme, vetzuur metabolisme, pentosefosfaat patway, gluconeogenese).
Voor de bio-ingenieurs behoort ook het metabolisme van aminozuren en nucleinezuren tot de leerstof
Samenhang met andere opleidingsonderdelen:
Voor de studenten is deze cursus een eerste kennismaking met de verschillende aspecten van de 'moleculaire biologie'. Deze cursus legt de basis waarop wordt voortgebouwd in alle moleculair biologische vakken van de opleidingen Biologie/scheikunde/bioingenieur.
Handboek:
Biochemistry, L. Stryer, Editie 10
Verplichte leerstof: Hoofstukken 1 tot 24 exclusief, 6, 12, 13, 14 & 15.
Practicumhandleiding:
Proef 1: Chromosomaal DNA en zijn eigenschappen
Proef 2: PAGE-electrophorese
Proef 3: Bepaling kinetische paparmeters van b-galactosidase
Proef 4: Chromatografische scheiding van een protein mengsel
Proef 5: Restrictiekaart van een plasmide
Proef 6: Moleculaire modellen
Aanvullend studiemateriaal:
De cursus wordt gedoceerd door gebruik van powerpoint slides
Doelstellingen
De studenten een conceptueel inzicht verschaffen in de moleculaire grondslagen van het leven. Waar mogelijk worden deze concepten bijgebracht aan de hand van experimentele gegevens om de studenten te confronteren met de proefondervindelijke methodiek van de moleculaire bioloog/enzymoloog/geneticus, ... Doorheen de cursus wordt gestreefd naar een integratie van de verschillende onderdelen. Een voorbeeld: de werking van pyruvaatcarboxylase wordt behandeld in deel 3 om aldus de concepten van enzymefunktie (deel 2 van de kursus) in een gepaste kontekst te herhalen.
Eindtermen
De studenten moeten in staat zijn:
- De covalente structuur van de belangrijkste biologische moleculen neer te schrijven
- De moleculaire krachten die de biochemische spelregels bepalen te beschrijven.
- De stroom van informatie (DNA replicatie, transcriptie en translatie) conceptueel uit te leggen.
- De structuur-functie relatie van biologische macromoleculen (DNA, eiwitten,...) aan de hand van concrete voorbeelden uit te leggen.
- De belangrijkste catabolische en anabolische wegen te beschrijven en deze in het globaal metabolisch netwerk te situeren.
De beoordeling bestaat uit volgende opdrachtcategorieën:
Examen Mondeling bepaalt 100% van het eindcijfer
Binnen de categorie Examen Mondeling dient men volgende opdrachten af te werken:
Het examen wordt schriftelijke voorbereid en mondeling afgenomen
Voorbeelden van examenvragen:
- Schrijf de covalente structuur van het peptide Lys Ala His Val. Wat is de netto lading van dit peptide bij pH5 ?
- Verklaar de coöperatieve eigenschappen van Hemoglobine.
- Beschrijf het proces van transcriptie
- Beschrijf het oxidatief deel van de oxidatieve fosforylatie
Deze aanbieding maakt deel uit van de volgende studieplannen:
Bachelor in de bio-ingenieurswetenschappen: profiel cel- en genbiotechnologie
Bachelor in de bio-ingenieurswetenschappen: profiel chemie en bioprocestechnologie
Bachelor in de bio-ingenieurswetenschappen: Startplan