3 ECTS credits
80 u studietijd

Aanbieding 1 met studiegidsnummer 4005244FNR voor alle studenten in het 1e semester met een gespecialiseerd master niveau.

Semester
1e semester
Inschrijving onder examencontract
Niet mogelijk
Beoordelingsvoet
Beoordeling (0 tot 20)
2e zittijd mogelijk
Ja
Inschrijvingsvereisten
Je hebt ‘Biofysische scheikunde' gevolgd, alvorens ‘Protein Engineering’ op te nemen. 'Protein Engineering’ opnemen houdt in dat je gelijktijdig 'Proteïnechemie, functie en structuur' volgt of reeds geslaagd bent voor 'Proteïnechemie, functie en structuur'.
Onderwijstaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit Wetenschappen en Bio-ingenieurswetensch.
Verantwoordelijke vakgroep
Bio-ingenieurswetenschappen
Onderwijsteam
Jan Steyaert (titularis)
Onderdelen en contacturen
26 contacturen Hoorcollege
Inhoud

This course aims at giving an overview of several methods to produce non-natural proteins and the uses thereof, often referred to as protein engineering. The course includes the following topics:

(1) Guidelines for functional analysis of engineered and mutant enzymes
(2) phi-value analysis of protein folding and stability
(3) engineering enantioselectivity
(4) Phage display systems for protein engineering
(5) Cell-free display systems for protein engineering
(6) library construction for protein engineering
(7) Design and engineering of synthetic binding proteins
(8) combinatorial enzyme engineering
(9) engineering of therapeutic proteins
(10) Inteins and protein cyclisation
(11) engineering using noncanonical amino acids
(12) Computer modeling, homology modeling and bioinformatics
(13) Knowledge based protein design
(14) from prospecting to product: metagenomics
(15) Modulating protein structure
(16) Modulating intrinsic properties of proteins
(17) designing protein switches
(18) chimeragenesis in protein engineering
(19) patway engineering
(20) silk proteins and biomaterials

Studiemateriaal
Digitaal cursusmateriaal (Vereist) : Slides
Handboek (Aanbevolen) : Handbook of Proteins, Structure, Function and Methods (2 volume set) , Cox - Phillips, Wiley, VCH, 9780470060988, 2008
Handboek (Aanbevolen) : Protein Engineering and Design, Sheldon J. Park (Editor), Jennifer R. Cochran (Editor), CRC press, 9781420076585, 2009
Bijkomende info

Mondeling hoorcollege aan de hand van slides die ter beschikking zijn van de studenten

Aanvullend studiemateriaal:
Protein Engineering Handbook (2-Volume Set) [Hardcover]
Stefan Lutz (Editor), Uwe Theo Bornscheuer (Editor)
Wiley, VCH

Protein Engineering and Design [Hardcover]
Sheldon J. Park (Editor), Jennifer R. Cochran (Editor)
CRC press

Leerresultaten

Algemene competenties

Protein engineering stelt zich tot doel rationeel de novo proteinen of varianten van betaande proteinen aan te maken met nieuwe eigenschappen. De cursus heeft als doel de studenten in te leiden in dit domein van de biotechnologie.

Eindtermen:

- De studenten kunnen uitleggen wat de protein-engineering cyclus is
- De studenten beheersen de nodige basistechnologie
- De studenten weten hoe protein engineering wordt toegepast om fundamentele aspekten van protein catalyse, -folding en -stabiliteit te bestuderen
- De studenten kennen praktjkvoorbeelden van rationele protein design.
- De studenten kennen de basisprincipes van antibody engineering
- De studenten kennen een aantal toepassingen van protein engineering in de landbouw, de industrie en de geneeskunde

Beoordelingsinformatie

De beoordeling bestaat uit volgende opdrachtcategorieën:
Examen Mondeling bepaalt 100% van het eindcijfer

Binnen de categorie Examen Mondeling dient men volgende opdrachten af te werken:

  • Mondeling examen met een wegingsfactor 1 en aldus 100% van het totale eindcijfer.

    Toelichting: Mondeling examen na schriftelijke voorbereiding.

    Type vragen:

    1) Beschrijf het principe van phage display
    2) Verklaar het mechanisme van inteins en beschrijf twee toepassingen

Aanvullende info mbt evaluatie

Mondeling examen na schriftelijke voorbereiding.

Type vragen:

1) Beschrijf het principe van phage display
2) Verklaar het mechanisme van inteins en beschrijf twee toepassingen

Toegestane onvoldoende
Kijk in het aanvullend OER van je faculteit na of een toegestane onvoldoende mogelijk is voor dit opleidingsonderdeel.

Academische context

Deze aanbieding maakt deel uit van de volgende studieplannen:
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: cel- en genbiotechnologie: medische biotechnologie
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: cel- en genbiotechnologie: moleculaire biotechnologie
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: cel- en genbiotechnologie: agrobiotechnologie
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: chemie en bioprocestechnologie: voedingsbiotechnologie
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: chemie en bioprocestechnologie: chemische biotechnologie
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: chemie en bioprocestechnologie: biochemische biotechnologie