6 ECTS credits
156 u studietijd
Aanbieding 1 met studiegidsnummer 1010277BNR voor alle studenten in het 2e semester met een verdiepend bachelor niveau.
Deze cursus behandelt een reeks biofysische technieken die gebruikt worden om verschillende aspecten van de drie dimensionale structuur van organische moleculen en biologische macromoleculen (eiwitten, DNA, RNA) te bepalen. Hierbij wordt ingegaan op X-straal diffractie met de nadruk op éénkristaldiffractie, kernmagnetische resonantie, massaspectrometrie en de klassieke spectroscopieën, met name UV absorptie, fluorescentie, circulair dichroisme, infrarood en Raman spectroscopie en lichtverstrooiing.
In de hoorcolleges wordt ingegaan op de theorie achter de methoden en hun praktische toepassingen worden geïllustreerd aan de hand van een aantal voorbeelden uit de litteratuur. Gedurende de practica worden deze technieken verder geïllustreerd. Dit gebeurt via een combinatie van eigen proefnemingen (kristallisatie van een eiwit) en demonstraties (X-straal data collectie, CD, UV en fluorescentie spectroscopie), aangevuld met structuuranalyse van een eiwit op computer.
Deelname aan de practica is verplicht. Tweede zittijd voor de practica is niet mogelijk. Per niet gewettigde afwezigheid op een practicumsessie wordt 1 punt van het totale examencijfer op 20 afgetrokken. Niet gewettigde afwezigheid op meer dan de helft van de practicumsessies leidt tot uitsluiting van deelname aan het examen.
- De studenten hebben grondige kennis van en inzicht in de theorie achter X-straal diffractie
- De studenten hebben grondige kennis van en inzicht in de theorie achter kernmagnetische resonantie en kunnen eenvoudige NMR spectra interpreteren
- De studenten begrijpen hoe drie-dimensionele structuren van macromoleculen kunnen worden bepaald via X-straal diffractie en NMR
- De studenten hebben kennis van en inzicht in de verschillende methoden van massaspectrometrie.
- De studenten hebben kennis van de verschillende spectroscopische methoden gebruikt in de biochemie (UV absorptie, UV fluorescentie, circulair dichroisme, infrarood en Raman spectroscopie, lichtverstrooiing) en kunnen deze toepassen op een eenvoudige casus binnen de biochemie
- De studenten hebben inzicht in de voor- en nadelen van de verschillende technieken m.b.t. structuurbepaling
- De studenten bezitten praktische basisvaardigheden met betrekking tot spectroscopische analyse en kristallisatie van macromoleculen, en kunnen zelf opgenomen diffractiepatronen en elektronendensiteit interpreteren.
De beoordeling bestaat uit volgende opdrachtcategorieën:
Examen Schriftelijk bepaalt 100% van het eindcijfer
Binnen de categorie Examen Schriftelijk dient men volgende opdrachten af te werken:
Schriftelijk examen (gesloten boek). De studenten krijgen een aantal vragen die de verschillende delen van de cursus omvatten: deel 1 X-straal diffractie, deel 2 NMR en deel 3 spectroscopie en massaspectrometrie. Er wordt gepeild naar zowel parate kennis als inzicht.
De drie delen krijgen eenzelfde gewicht bij de berekening van het eindcijfer.
Het practicum dient ter ondersteuning en illustratie van de hoorcolleges. Praktische vaardigheden worden enkel formatief beoordeeld tijdens de practicumsessies als voorbereiding op het schriftelijk examen. Aanwezigheid en actieve deelname aan de practica zijn daarom vereist, tenzij reeds een vrijstelling behaald werd. Per niet gewettigde afwezigheid op een practicumsessie wordt 1 punt van het totale examencijfer op 20 afgetrokken. Niet gewettigde afwezigheid op meer dan de helft van de practicumsessies leidt tot uitsluiting van deelname aan het examen.
Deze aanbieding maakt deel uit van de volgende studieplannen:
Bachelor in de chemie: Standaard traject