3 ECTS credits
90 u studietijd
Aanbieding 1 met studiegidsnummer 1010274BNR voor alle studenten in het 1e semester met een verdiepend bachelor niveau.
In dit studiedeel worden de theoretische principes en concepten van microbiologie en gentechnologie in de praktijk toegepast. Studenten zullen vertrouwd gemaakt worden met moleculair-biologische experimentele technieken en onderzoeksmethoden die vaak geïmplementeerd worden in een biotechnologische onderzoeksomgeving. De microbiële diversiteit zal onderzocht worden door het isoleren van micro-organismen uit omgevingsstalen. Identificatie en karakterisering van deze isolaten zal gebeuren door een typische fylogenetische analyse door 16S rRNA sequenering, aangevuld met fenotypische analysemethoden (microscopie, Gramkleuring, analyse van metabolische eigenschappen, katalase en oxidase test en analyse van de productie van antimicrobiële verbindingen, quorum sensing signaalmoleculen en sideroforen). Daarnaast zal de studie van microbiële groei geïllustreerd worden door kwantitatieve groeiexperimenten (in vloeibare cultuur en door uitplaten). In een ander experiment zal het verband gelegd worden tussen microbiële fysiologie en gentechnologie door het uitvoeren van een transposonmutagenese-experiment in Pseudomonas: hierbij wordt een mutantenbank aangemaakt en gescreend voor siderofoor-negatieve mutanten. Geselecteerde mutanten worden vervolgens geanalyseerd met behulp van PCR-methoden en sequentie-analyse om het gemuteerde gen te identificeren in het genoom. Tot slot zullen alle stappen van een moleculair kloneringsexperiment doorlopen worden, gaande van het ontwerp van oligonucleotide primersequenties, DNA-extractie- en -elektroforese methoden, PCR-methoden en transformatie in Escherichia coli. Doorheen de verschillende onderdelen zullen studenten ook in aanraking komen met basis-bio-informatica tools die gebruikt worden voor sequentie-analysen.
Studenten dienen verplicht aanwezig te zijn bij de practica.
Studenten kunnen de verschillende experimentele stappen in een biotechnologisch onderzoeksproject (bv. moleculaire klonering, identificatie van een microbiële stam) verantwoorden en uitleggen.
Studenten kunnen technieken uitvoeren die eigen zijn aan moleculair-biologische en microbiële onderzoeksexperimenten (o.a. steriel werken en nauwkeurig pipetteren).
Studenten kunnen resultaten van microbiële en gentechnologische experimenten interpreteren en uitleggen in het kader van microbiële fysiologie en genetica.
Studenten kunnen sequentie-analysen uitvoeren door gebruik te maken van basis bio-informatica-tools.
De beoordeling bestaat uit volgende opdrachtcategorieën:
WPO Presentatie bepaalt 50% van het eindcijfer
WPO Praktijkopdracht bepaalt 30% van het eindcijfer
WPO Verslag bepaalt 20% van het eindcijfer
Binnen de categorie WPO Presentatie dient men volgende opdrachten af te werken:
Binnen de categorie WPO Praktijkopdracht dient men volgende opdrachten af te werken:
Binnen de categorie WPO Verslag dient men volgende opdrachten af te werken:
Niet van toepassing.
Dit studiedeel maakt geen deel uit van vastgelegde afstudeervereisten. Het is aldus een vrij keuzevak.